Evaluación In Silico De La Afinidad De 12 Moléculas Sobre Proteínas Involucradas En La Formación De Biopelicula De Streptococcus Mutans

dc.contributor.advisorRivera Quiroga, Raul Eduardospa
dc.contributor.authorZapata Tovar, Allison Natalyspa
dc.contributor.authorTrejos Perez, Valentinaspa
dc.contributor.authorMartinez Correa, Danielaspa
dc.coverage.spatialAremenia, Quindio , Colombiaspa
dc.creator.cedula20571722486spa
dc.creator.cedula20571728660spa
dc.creator.cedula20571725506spa
dc.date.accessioned2023-10-07T12:56:25Z
dc.date.available2023-10-07T12:56:25Z
dc.date.issued2022-06-21spa
dc.description.abstractOf the infectious diseases affecting humans, dental caries is probably the most prevalent. Dental caries is described as a dynamic process of demineralization and remineralization, a product of bacterial metabolism on the tooth surface, which over time can produce a net loss of minerals and possibly, but not always, result in the presence of a cavity. Oral bacteria belong to a complex community of numerous species that participate in the formation of bacterial plaque (biofilm or biofilm) with all its functions, interactions and properties. The current concept contemplates that several microorganisms are included in the pathogenesis of dental caries, with Streptococcus mutans being the most important agent associated with it. Streptococcus mutans has different proteins involved in biofilm formation. Bioinformatics strategies for the search of drugs for the treatment of different diseases can be used in dentistry, so with this work it was possible to evaluate In silico the affinity of twelve molecules on proteins involved in the biofilm formation of Streptococcus mutans. Twelve molecules previously reported by (Rivera-Quiroga et al., 2021) were selected and remote docking with six proteins GBP-C, CE4 esterase, GTF-C, sortase A and two Ag I/II domains were performed to identify the affinity of these molecules on these proteinseng
dc.description.abstractDe las enfermedades infecciosas que afectan a los seres humanos, la caries dental es probablemente la más prevalente. Se describe la caries dental como un proceso dinámico de desmineralización y remineralización, producto del metabolismo bacteriano sobre la superficie dentaria, que con el tiempo puede producir una pérdida neta de minerales y posiblemente, aunque no siempre, resultará en la presencia de una cavidad. Las bacterias orales pertenecen a una comunidad compleja de numerosas especies que participan en la formación de la placa bacteriana (biofilm o biopelículas) con todas sus funciones, interacciones y propiedades. El concepto actual contempla que varios microorganismos se incluyen en la patogénesis de la caries dental, siendo el Streptococcus mutans (S. mutans) es el agente más importante asociado a ella. El Streptococcus mutans tiene diferentes proteínas involucradas en la formación de biofilm. Las estrategias bioinformáticas para la búsqueda de fármacos que sirvan para el tratamiento de diferentes enfermedades, pueden ser utilizados en la odontología, por eso con este trabajo se logró evaluar In silico la afinidad de doce moléculas sobre proteínas involucradas en la formación de biofilm del Streptococcus mutans. Se seleccionaron doce moléculas previamente reportadas por (Rivera-Quiroga et al., 2021) y se realizaron acoplamientos remotos con seis proteínas GBPC, esterasa CE4, GTF-C, sortasa A y dos dominios del Ag I/II para identificar la afinidad de estas moléculas sobre dichas proteínas.spa
dc.description.degreelevelPregradospa
dc.description.degreenameOdontólogo(a)spa
dc.description.degreetypeInvestigaciónspa
dc.description.notesPresencialspa
dc.identifier.bibliographicCitationAccelrys. (2006). Introduction to the Discovery Studio Visualizer. 1–31.spa
dc.identifier.bibliographicCitationAjdić, D., McShan, W. M., McLaughlin, R. E., Savić, G., Chang, J., Carson, M. B., Primeaux, C., Tian, R., Kenton, S., Jia, H., Lin, S., Qian, Y., Li, S., Zhu, H., Najar, F., Lai, H., White, J., Roe, B. A., & Ferretti, J. J. (2002). Genome sequence of Streptococcus mutans UA159, a cariogenic dental pathogen. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 99(22), 14434–14439. https://doi.org/10.1073/pnas.172501299spa
dc.identifier.bibliographicCitationAllouche, A. (2012). Software News and Updates Gabedit — A Graphical User Interface for Computational Chemistry Softwares. Journal of Computational Chemistry, 32, 174–182. https://doi.org/10.1002/jccspa
dc.identifier.bibliographicCitationBai, G., Tian, Y., Wu, J., Gu, Y., Chen, Z., Zeng, F., & Liu, J. (2019). Construction of a fusion anti-caries DNA vaccine in transgenic tomato plants for PAcA gene and cholera toxin B subunit. Biotechnology and Applied Biochemistry, 66(6), 924–929. https://doi.org/10.1002/bab.1806spa
dc.identifier.bibliographicCitationBerman. (2000). The Protein Data Bank. 2000 Oxford University Press, 28(5), 235–242. https://doi.org/10.1038/s41577-020-00473-zspa
dc.identifier.bibliographicCitationClarke, T. K. (1975). Streptococcus mutans and dental caries. British Medical Journal, 4(5997), 647–648. https://doi.org/10.1136/bmj.4.5997.647-dspa
dc.identifier.bibliographicCitationCrowley, P. J., Brady, L. J., Michalek, S. M., & Bleiweis, A. S. (1999). Virulence of a spaP mutant of Streptococcus mutans in a gnotobiotic rat model. Infection and Immunity, 67(3), 1201–1206. https://doi.org/10.1128/iai.67.3.1201-1206.1999spa
dc.identifier.bibliographicCitationDeng, D. M., Urch, J. E., ten Cate, J. M., Rao, V. A., van Aalten, D. M. F., & Crielaard, W. (2009). Streptococcus mutans SMU.623c codes for a functional, metal-dependent polysaccharide deacetylase that modulates interactions with salivary agglutinin. Journal of Bacteriology, 191(1), 394–402. https://doi.org/10.1128/JB.00838-08spa
dc.identifier.bibliographicCitationGao, X., Jiang, S., Koh, D., & Hsu, C. Y. S. (2016). Salivary biomarkers for dental caries. Periodontology 2000, 70(1), 128–141. https://doi.org/10.1111/prd.12100spa
dc.identifier.bibliographicCitationHerrera, I. R. (2012). Prevalencia de caries dental y factores de riesgo asociados. Revista Cubana de Medicina Militar.spa
dc.identifier.instnameinstname:Universidad Antonio Nariñospa
dc.identifier.reponamereponame:Repositorio Institucional UANspa
dc.identifier.repourlrepourl:https://repositorio.uan.edu.co/spa
dc.identifier.urihttp://repositorio.uan.edu.co/handle/123456789/8774
dc.language.isospaspa
dc.publisherUniversidad Antonio Nariñospa
dc.publisher.campusArmeniaspa
dc.publisher.facultyFacultad de Odontologíaspa
dc.publisher.programOdontologíaspa
dc.rightsAcceso abierto
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessspa
dc.rights.coarhttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2spa
dc.rights.licenseAttribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International (CC BY-NC-ND 4.0)spa
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/spa
dc.subjectCaries dentales_ES
dc.subjectbioinformáticaes_ES
dc.subjectS. mutanses_ES
dc.subject.keywordDental carieses_ES
dc.subject.keywordBioinformaticses_ES
dc.subject.keywordS. mutanses_ES
dc.titleEvaluación In Silico De La Afinidad De 12 Moléculas Sobre Proteínas Involucradas En La Formación De Biopelicula De Streptococcus Mutanses_ES
dc.typeTrabajo de grado (Pregrado y/o Especialización)spa
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fspa
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