Genes asociados a la síntesis y resistencia de compuestos antimicrobianos en islas de recursos de un ambiente semiárido del Caribe Colombiano.

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dc.contributor.advisorVanegas Guerrero, Javierspa
dc.contributor.advisorArenas Suárez, Nelson Enriquespa
dc.contributor.authorCamargo Montoya, Martha Lilianaspa
dc.creator.cedula11932011274spa
dc.date.accessioned2022-04-30T16:22:55Z
dc.date.available2022-04-30T16:22:55Z
dc.date.issued2021-11-26spa
dc.description.abstractThe phylum Actinobacteria is of great importance for its capacity for biosynthesis and resistance of antimicrobial compounds and dominance in soil microbiomes. It is considered that unexplored and extreme environments such as resource islands in arid and semi-arid zones of the tropics can be a source of a great diversity of Actinobacteria and therefore of potential compounds of biotechnological interest. The objective of this study was to determine the effect of seasonality and the presence of vegetation on the abundance of actinobacteria and genes associated with the synthesis and resistance of antimicrobial compounds associated with three resource islands in a semiarid region of the Colombian Caribbean. For this purpose, three nurse trees Prosopis juliflora, Haematoxylum brasiletto and Pithecellobium dulce were sampled under canopy (V), bare soil (C) both in wet (W) and dry season (D). Total DNA was extracted and sequenced. From the sequences, 16 orders, 28 families and 52 genera of actinobacteria with higher abundances in CD were detected. In addition, 16 antimicrobial compound biosynthesis pathways were detected, of which the synthesis pathways of monobactam antibiotics, prodigiosin and streptomycin were the most abundant. These pathways showed higher abundances in DV. Ten antibiotic resistance pathways were detected including the highest abundances for rifamycin in CD and streptogramins (MLS) in VW. It was observed that the diversity and abundance of actinobacterial biosynthesis and resistance genes were influenced by seasonality and the presence of vegetation in the resource islands.eng
dc.description.abstractEl filo Actinobacteria es de gran importancia por su capacidad de biosíntesis y resistencia de compuestos antimicrobianos y dominancia en microbiomas de suelos. Se considera que ambientes inexplorados y extremos como las islas de recursos de zonas áridas y semiáridas del trópico pueden ser fuente de una gran diversidad de Actinobacterias y, por tanto, de potenciales compuestos de interés biotecnológico. El objetivo del trabajo fue determinar el efecto de la estacionalidad y la presencia de vegetación sobre la abundancia de Actinobacterias y genes asociados a la síntesis y resistencia de compuestos antimicrobianos asociados a tres islas de recursos de una región semiárida del Caribe Colombiano. Para esto se muestrearon tres árboles nodriza Prosopis juliflora, Haematoxylum brasiletto y Pithecellobium dulce, bajo el dosel (V) y suelo desnudo (C) tanto en temporada húmeda (W) y como en temporada seca (D). Se extrajo el DNA total y se secuenció. A partir de las secuencias se detectaron 16 órdenes, 28 familias y 52 géneros de Actinobacterias con mayores abundancias en CD. Adicionalmente se detectaron 16 vías de biosíntesis de compuestos antimicrobianos, de las cuales, las vías de síntesis de antibióticos monobactámicos, prodigiosina y estreptomicina fueron las de mayor abundancia. Estas vías presentaron mayores abundancias en VD. Se detectaron 10 vías de resistencia a antibióticos que incluyen las mayores abundancias para rifamicina en CD y estreptograminas (MLS) e VW. Se observó que la diversidad y abundancia de Actinobacterias y genes de biosíntesis y resistencia estuvieron influenciados por la estacionalidad y la presencia de vegetación en las islas de recursos.spa
dc.description.degreelevelMaestríaspa
dc.description.degreenameMagíster en Bioquímicaspa
dc.description.degreetypeMonografíaspa
dc.description.notesPresencialspa
dc.identifier.bibliographicCitationAbdelshafy Mohamad, O. A., Li, L., Ma, J.-B., Hatab, S., Rasulov, B. A., Musa, Z., Liu, Y.-H., & Li, W.-J. (2018). Halophilic actinobacteria biological activity and potential applications. In D. Egamberdieva, N.-K. Birkeland, H. Panosyan, & W.-J. Li (Eds.), Extremophiles in eurasian ecosystems: ecology, diversity, and applications (Vol. 8, pp. 333–364). Springer Singapore. https://doi.org/10.1007/978-981-13-0329-6_12spa
dc.identifier.bibliographicCitationAndersson, D. I., & Hughes, D. (2010). Antibiotic resistance and its cost: is it possible to reverse resistance? Nature Reviews. Microbiology, 8(4), 260–271. https://doi.org/10.1038/nrmicro2319spa
dc.identifier.bibliographicCitationAraujo Carrillo, G. A., Martínez Maldonado, F. E., Deantonio Florido, L. Y., & Gómez Latorre, D. A. (2019). Agroclimatic zoning: a planning strategy for agricultural and livestock systems in Alta Guajira, Colombia. Revista Colombiana de Ciencias Hortícolas.spa
dc.identifier.bibliographicCitationArenas, N. E., & Moreno Melo, V. (2018). Producción pecuaria y emergencia de antibiótico resistencia en Colombia: Revisión sistemática. Infectio, 22(2), 110. https://doi.org/10.22354/in.v22i2.717spa
dc.identifier.bibliographicCitationArocha-Garza, H. F., Canales-Del Castillo, R., Eguiarte, L. E., Souza, V., & De la Torre-Zavala, S. (2017). High diversity and suggested endemicity of culturable Actinobacteria in an extremely oligotrophic desert oasis. PeerJ, 5, e3247. https://doi.org/10.7717/peerj.3247spa
dc.identifier.bibliographicCitationÁvila-Calderón, L. E. A., & Rutiaga-Quiñones, J. (2014). Componentes químicos de la madera y la corteza de Haematoxylum brasiletto Karsten (Leguminosae). Madera y Bosques, 20(2), 153–158. https://doi.org/10.21829/myb.2014.202171spa
dc.identifier.bibliographicCitationAyala-Niño, F., Maya-Delgado, Y., & Troyo-Diéguez, E. (2018). Almacenamiento y flujo de carbono en suelos áridos como servicio ambiental: Un ejemplo en el noroeste de México. Revista Terra Latinoamericana, 36(2), 93. https://doi.org/10.28940/terra.v36i2.334spa
dc.identifier.bibliographicCitationAzman, A.-S., Othman, I., Velu, S. S., Chan, K.-G., & Lee, L.-H. (2015). Mangrove rare actinobacteria: taxonomy, natural compound, and discovery of bioactivity. Frontiers in Microbiology, 6, 856. https://doi.org/10.3389/fmicb.2015.00856spa
dc.identifier.bibliographicCitationBai, Y., She, W., Miao, L., Qin, S., & Zhang, Y. (2020). Soil microbial interactions modulate the effect of Artemisia ordosica on herbaceous species in a desert ecosystem, northern China. Soil Biology and Biochemistry, 150, 108013. https://doi.org/10.1016/j.soilbio.2020.108013spa
dc.identifier.bibliographicCitationBashan, Y., Salazar, B. G., Moreno, M., Lopez, B. R., & Linderman, R. G. (2012). Restoration of eroded soil in the Sonoran Desert with native leguminous trees using plant growth-promoting microorganisms and limited amounts of compost and water. Journal of Environmental Management, 102, 26–36. https://doi.org/10.1016/j.jenvman.2011.12.032spa
dc.identifier.instnameinstname:Universidad Antonio Nariñospa
dc.identifier.reponamereponame:Repositorio Institucional UANspa
dc.identifier.repourlrepourl:https://repositorio.uan.edu.co/spa
dc.identifier.urihttp://repositorio.uan.edu.co/handle/123456789/6384
dc.language.isospaspa
dc.publisherUniversidad Antonio Nariñospa
dc.publisher.campusBogotá - Circunvalarspa
dc.publisher.facultyFacultad de Cienciasspa
dc.publisher.programMaestría en Bioquímicaspa
dc.rightsAcceso abierto
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessspa
dc.rights.coarhttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2spa
dc.rights.licenseAttribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International (CC BY-NC-ND 4.0)spa
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/spa
dc.subjectMetagenómicaes_ES
dc.subjectIslas de recursoses_ES
dc.subjectGenes de resistencia a antibióticoses_ES
dc.subjectBiosíntesis de compuestos antimicrobianoses_ES
dc.subjectDesertificaciónes_ES
dc.subject.ddc540es_ES
dc.subject.keywordMetagenomicses_ES
dc.subject.keywordResource islandses_ES
dc.subject.keywordAntibiotic resistance geneses_ES
dc.subject.keywordAntimicrobial compound biosynthesises_ES
dc.subject.keywordDesertificationes_ES
dc.titleGenes asociados a la síntesis y resistencia de compuestos antimicrobianos en islas de recursos de un ambiente semiárido del Caribe Colombiano.es_ES
dc.typeTesis y disertaciones (Maestría y/o Doctorado)spa
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdccspa
dc.type.coarversionhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
dc.type.localTesis/Trabajo de grado - Monografía - Maestríaspa
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Maestría en Bioquímica