Niveles de abertura como estrategia de enseñanza en la simulación de espectros de absorción de rayos-X (XAS). Aplicados a modelos biomoleculares.

Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International (CC BY-NC-ND 4.0)Malagon Bernal, Edwin AndresMore Osorio, Laura Liliana2021-02-222021-02-222020-06-05http://repositorio.uan.edu.co/handle/123456789/1604Computational approaches to simulate spectra of multiple analytical techniques and evaluations of experimental data have gained importance in recent years in teaching at the undergraduate level. This manuscript presents a teaching strategy that trains students in the basic skills of obtaining simulated spectra within the framework of the ATOMS, ARTEMIS, ATHENA software. In addition, students can simulate X-ray absorption spectra (XAS) from various prosthetic groups with high biological relevance, a cornerstone of the enzyme, and a key topic in many undergraduate biochemistry courses. Additionally, students can simulate X-ray absorption spectra (XAS) from various prosthetic groups with high biological relevance, a cornerstone of the enzyme, and a key topic in many undergraduate biochemistry courses. Several examples of spectrum simulation are introduced here from available crystallographic information for various types of hemoglobin, vitamin b12, rubredoxin and carbonic anhydrase. In addition, an example of molecular refinement and an XAS application were applied to understand bacterial metabolic processes. This practice develops understanding in the areas of bioinorganic chemistry, spectroscopy, coding skills, and XAS spectrum analysis. An application-based guide for undergraduate students was obtained.Los enfoques computacionales para simular espectros de múltiples técnicas analíticas y evaluar datos experimentales han cobrado importancia en los últimos años en la enseñanza a nivel de pregrado. La dificultad de acceso al uso de los equipos y lo costoso del proceso hacen que su aplicación en programas de tipo pregrado sea restringido. Este manuscrito presenta una estrategia de enseñanza que entrena a los estudiantes en habilidades básicas de obtención de espectros simulados dentro del marco de trabajo se utilizaron los softwares ATOMS, ARTEMIS, ATHENA. Además, los estudiantes pueden simular espectros de absorción de rayos-X (XAS) de varios grupos prostéticos con gran relevancia biológica, piedra angular de la enzimática y un tema clave en muchos cursos de bioquímica en pregrado. Se introducen aquí varios ejemplos de simulación de espectros a partir de información cristalográfica disponible para varios tipos de hemoglobina, vitamina b12, rubredoxina y anhidrasa carbónica. Además se aplicó ejemplo de refinamiento molecular y un aplicativo de XAS para entender procesos metabólicos bacterianos. esta práctica desarrolla la comprensión en las áreas de química bioinorgánica, espectroscopia, habilidades de codificación y análisis de espectros XAS se obtuvo una guía base aplicativa a estudiantes de pregrado.spaAcceso a solo metadatosSimulación de espectroAbsorción de rayos XMetaloproteínasCoordinación químicaGeometría químicaNiveles de abertura como estrategia de enseñanza en la simulación de espectros de absorción de rayos-X (XAS). Aplicados a modelos biomoleculares.Trabajo de grado (Pregrado y/o Especialización)Spectrum simulationX-ray absorptionMetalloproteinsChemical coordinationChemical geometry.info:eu-repo/semantics/closedAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_14cbHendrickson WA. X Rays in Molecular Biophysics. Phys Today. 1995;48(11):42–8. 2. Hércules DE. Brasil acoge la edición latinoamericana de hércules. 2020;1–4. 3. Baran EJ. 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